[1]　八代南IC

E3A南九州道　八代南IC

八代JCTからの距離：6.6km
住所：〒866-0074
熊本県八代市平山新町
インターチェンジ名：八代南
工事中の仮称：八代南
出口標識：八代南
料金所番号：02-337
レーン情報：
[入口]　ETC専用：1／ETC優先(サポート)：1
[出口]　ETC専用：1／ETC優先：1
接続先の道路：国道3号
運用開始日：
（鹿児島方面）2001年10月6日
（熊本方面）1998年4月20日
インターチェンジの形状：トランペット型
バスストップ併設：×
料金所の管轄：西日本高速道路九州支社　熊本高速道路事務所
解説：1998年に開通した、熊本県区間のE3A南九州道では最初のインターチェンジ。八代JCTで鹿児島・宮崎・人吉方面に乗り換えることが出来ないため、事実上、このインターがフルジャンクションの代替を果たしている。上り方向から八代市街へ向かう場合にも便利。

[2]　日奈久IC

E3A南九州道　日奈久IC

八代JCTからの距離：12.0km
住所：〒869-5138
熊本県八代市日奈久平成町
インターチェンジ名：日奈久
工事中の仮称：日奈久
出口標識：日奈久
料金所番号：02-379（日奈久本線）
日奈久本線料金所：
[熊本方面]　ETC専用：1／ETC優先(サポート)：1
[水俣方面]　ETC専用：2／ETC優先：1
接続先の道路：国道3号
運用開始日：
（鹿児島方面）2005年2月19日
（熊本方面）2001年10月6日
インターチェンジの形状：変則ハート型
バスストップ併設：×
料金所の管轄：西日本高速道路九州支社　熊本高速道路事務所
解説：日奈久温泉の最寄りインターで、NEXCO西日本が管理する熊本県区間の有料道路はココで終わり。以前はその先の田浦・水俣方面も有料道路にする予定だったため、ランプウェイ内に事務所の跡地が残されている。目の前に八代海が迫るため、インターチェンジの造りがやや複雑。八代インターから日奈久インターの通行料が、距離の割に約800円程度も掛かるため、この部分だけ迂回するドライバーが多く、狭隘道路が続く日奈久温泉街は渋滞が起きやすい。

E3A南九州道　田浦IC

八代JCTからの距離：20.8km
住所：〒869-5302
熊本県葦北郡芦北町田浦
インターチェンジ名：田浦
工事中の仮称：田浦
出口標識：田浦　道の駅たのうら
接続先の道路：国道3号
運用開始日：
（鹿児島方面）2009年4月29日
（熊本方面）2005年2月27日
インターチェンジの形状：T字路型
バスストップ併設：×
インターチェンジの管轄：国土交通省　九州地方整備局　八代河川国道事務所
解説：芦北町発足前の旧・田浦町に設けられたインターチェンジ。国道3号における「三太郎峠」の一つ・赤松太郎峠の麓に位置する。インターの真正面に道の駅たのうらがあり、国土交通省ではE3A南九州道利用者に対し、この道の駅をパーキングエリア代替の休憩拠点としてお勧めしている。

E3A南九州道　芦北IC

八代JCTからの距離：28.8km
住所：〒869-5442
熊本県葦北郡芦北町花岡
インターチェンジ名：芦北
工事中の仮称：芦北
出口標識：芦北　道の駅芦北でこぽん
接続先の道路：熊本県道27号芦北球磨線
運用開始日：
（鹿児島方面）2016年2月27日
（熊本方面）2009年4月29日
インターチェンジの形状：T字路型
バスストップ併設：×
インターチェンジの管轄：国土交通省　九州地方整備局　八代河川国道事務所
解説：合併前の旧・芦北町に設置されたインターチェンジ。芦北町役場のある中心部に対し、少し東寄りの山奥に設けられている。インターチェンジの隣に道の駅があり、国土交通省ではE3A南九州道利用者に対し、この道の駅をパーキングエリア代替の休憩拠点としてお勧めしている。球磨村・人吉方面へは、当インターからが便利。

E3A南九州道　津奈木IC

八代JCTからの距離：36.5km
住所：〒869-5601
熊本県葦北郡津奈木町千代
インターチェンジ名：津奈木
工事中の仮称：津奈木
出口標識：津奈木
接続先の道路：国道3号
運用開始日：
（鹿児島方面）2019年3月2日
（熊本方面）2016年2月27日
インターチェンジの形状：ハーフインターの組み合わせ
バスストップ併設：×
インターチェンジの管轄：国土交通省　九州地方整備局　八代河川国道事務所
解説：国道3号の難所・津奈木太郎峠の麓に面するインターチェンジ。津奈木町最寄りのインターだが、出水・水俣方面からの場合は、隣の水俣インターからの方が若干アクセスしやすい。津奈木インターの前後区間は、雀の涙程度の追越車線を確保（約500m）。

E3A南九州道　水俣IC

八代JCTからの距離：42.1km
住所：〒867-0003
熊本県水俣市ひばりヶ丘
インターチェンジ名：水俣
工事中の仮称：水俣
出口標識：水俣
接続先の道路：国道3号・国道268号
運用開始日：
（熊本方面）2019年3月2日
インターチェンジの形状：トランペット型
バスストップ併設：×
インターチェンジの管轄：国土交通省　九州地方整備局　八代河川国道事務所
解説：2020年現在における熊本県区間の末端部。文字通り水俣市の中心部に近い。国道268号と直通しているため、高速道路等が通らない鹿児島県伊佐市（大口地区）への最寄りインターにもなっている。